MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 50906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	GCA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
2	NC_015519	CAA	2	6	185	190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798024
3	NC_015519	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
4	NC_015519	AAAAC	2	10	306	315	80 %	0 %	0 %	20 %	332798024
5	NC_015519	TGT	2	6	321	326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798024
6	NC_015519	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
7	NC_015519	AGA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
8	NC_015519	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798024
9	NC_015519	TGG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798024
10	NC_015519	TCGCT	2	10	483	492	0 %	40 %	20 %	40 %	332798024
11	NC_015519	GCA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
12	NC_015519	T	6	6	543	548	0 %	100 %	0 %	0 %	332798024
13	NC_015519	CATG	2	8	585	592	25 %	25 %	25 %	25 %	332798024
14	NC_015519	TA	3	6	604	609	50 %	50 %	0 %	0 %	332798024
15	NC_015519	CAG	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798024
16	NC_015519	TCTT	2	8	642	649	0 %	75 %	0 %	25 %	332798024
17	NC_015519	TAA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
18	NC_015519	TGA	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
19	NC_015519	TTC	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798024
20	NC_015519	ATG	2	6	815	820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
21	NC_015519	CCGC	2	8	849	856	0 %	0 %	25 %	75 %	332798024
22	NC_015519	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798024
23	NC_015519	A	8	8	962	969	100 %	0 %	0 %	0 %	332798024
24	NC_015519	ATG	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
25	NC_015519	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798024
26	NC_015519	TCA	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798024
27	NC_015519	TTC	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798024
28	NC_015519	GAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
29	NC_015519	GAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
30	NC_015519	GAA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798024
31	NC_015519	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	332798024
32	NC_015519	TAA	2	6	1450	1455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798024
33	NC_015519	ATG	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
34	NC_015519	GAAT	2	8	1885	1892	50 %	25 %	25 %	0 %	332798025
35	NC_015519	AT	4	8	2011	2018	50 %	50 %	0 %	0 %	332798025
36	NC_015519	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798025
37	NC_015519	GAT	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
38	NC_015519	TGGA	2	8	2238	2245	25 %	25 %	50 %	0 %	332798025
39	NC_015519	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798025
40	NC_015519	TAA	2	6	2430	2435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798025
41	NC_015519	GAC	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798025
42	NC_015519	AAT	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798025
43	NC_015519	GCA	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798025
44	NC_015519	T	6	6	2708	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	332798025
45	NC_015519	TAAAA	2	10	2743	2752	80 %	20 %	0 %	0 %	332798025
46	NC_015519	TAT	2	6	2782	2787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798025
47	NC_015519	ATTTT	2	10	2817	2826	20 %	80 %	0 %	0 %	332798025
48	NC_015519	GAAA	2	8	2865	2872	75 %	0 %	25 %	0 %	332798026
49	NC_015519	T	6	6	2927	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	332798026
50	NC_015519	CGG	2	6	2937	2942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798026
51	NC_015519	GCT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798026
52	NC_015519	T	6	6	3159	3164	0 %	100 %	0 %	0 %	332798027
53	NC_015519	TATT	2	8	3205	3212	25 %	75 %	0 %	0 %	332798027
54	NC_015519	AG	3	6	3245	3250	50 %	0 %	50 %	0 %	332798027
55	NC_015519	T	6	6	3283	3288	0 %	100 %	0 %	0 %	332798027
56	NC_015519	GACA	2	8	3323	3330	50 %	0 %	25 %	25 %	332798027
57	NC_015519	TA	3	6	3337	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	332798027
58	NC_015519	A	7	7	3351	3357	100 %	0 %	0 %	0 %	332798027
59	NC_015519	A	7	7	3380	3386	100 %	0 %	0 %	0 %	332798027
60	NC_015519	GGA	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798027
61	NC_015519	TGC	2	6	3675	3680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798027
62	NC_015519	ATC	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798027
63	NC_015519	ATT	2	6	3705	3710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798027
64	NC_015519	GATT	2	8	3763	3770	25 %	50 %	25 %	0 %	332798027
65	NC_015519	GAT	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798027
66	NC_015519	T	7	7	3883	3889	0 %	100 %	0 %	0 %	332798027
67	NC_015519	GAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798027
68	NC_015519	ACAT	2	8	4038	4045	50 %	25 %	0 %	25 %	332798027
69	NC_015519	GCAG	2	8	4047	4054	25 %	0 %	50 %	25 %	332798027
70	NC_015519	ATC	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798027
71	NC_015519	TATT	2	8	4083	4090	25 %	75 %	0 %	0 %	332798027
72	NC_015519	ATTC	2	8	4108	4115	25 %	50 %	0 %	25 %	332798027
73	NC_015519	GGA	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798027
74	NC_015519	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	332798027
75	NC_015519	CTG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798028
76	NC_015519	A	8	8	4216	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
77	NC_015519	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798028
78	NC_015519	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
79	NC_015519	ACA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332798028
80	NC_015519	TTTA	2	8	4374	4381	25 %	75 %	0 %	0 %	332798028
81	NC_015519	A	7	7	4465	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
82	NC_015519	AGA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798028
83	NC_015519	GAT	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
84	NC_015519	AT	3	6	4550	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	332798028
85	NC_015519	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
86	NC_015519	AAG	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798028
87	NC_015519	TGA	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798028
88	NC_015519	ATAAA	2	10	4629	4638	80 %	20 %	0 %	0 %	332798028
89	NC_015519	A	6	6	4636	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	332798028
90	NC_015519	AGT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798029
91	NC_015519	GAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798029
92	NC_015519	TA	3	6	4799	4804	50 %	50 %	0 %	0 %	332798029
93	NC_015519	A	7	7	4822	4828	100 %	0 %	0 %	0 %	332798029
94	NC_015519	CAG	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798029
95	NC_015519	AAG	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798029
96	NC_015519	ATT	2	6	4854	4859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332798029
97	NC_015519	A	7	7	4949	4955	100 %	0 %	0 %	0 %	332798030
98	NC_015519	ATG	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
99	NC_015519	AAAAT	2	10	4970	4979	80 %	20 %	0 %	0 %	332798030
100	NC_015519	TA	3	6	5026	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	332798030
101	NC_015519	CAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798030
102	NC_015519	TGA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
103	NC_015519	GAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
104	NC_015519	TGC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
105	NC_015519	CGG	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
106	NC_015519	TGGA	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	332798030
107	NC_015519	TCT	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332798030
108	NC_015519	GAA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
109	NC_015519	AT	3	6	5498	5503	50 %	50 %	0 %	0 %	332798030
110	NC_015519	AG	3	6	5518	5523	50 %	0 %	50 %	0 %	332798030
111	NC_015519	TGA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
112	NC_015519	GGT	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798030
113	NC_015519	TGC	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
114	NC_015519	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
115	NC_015519	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798030
116	NC_015519	ATGA	2	8	5821	5828	50 %	25 %	25 %	0 %	332798030
117	NC_015519	AAGGG	2	10	5889	5898	40 %	0 %	60 %	0 %	332798030
118	NC_015519	CAAA	2	8	5947	5954	75 %	0 %	0 %	25 %	332798030
119	NC_015519	TTG	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332798030
120	NC_015519	GTA	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
121	NC_015519	AGC	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
122	NC_015519	TGG	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798030
123	NC_015519	GAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
124	NC_015519	GAG	2	6	6382	6387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798030
125	NC_015519	GCTGAT	2	12	6430	6441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798030
126	NC_015519	T	7	7	6478	6484	0 %	100 %	0 %	0 %	332798030
127	NC_015519	GCC	2	6	6534	6539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332798030
128	NC_015519	TGA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798030
129	NC_015519	CAG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
130	NC_015519	GGC	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
131	NC_015519	AGC	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798030
132	NC_015519	AGA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798030
133	NC_015519	GCT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798030
134	NC_015519	GGC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332798030
135	NC_015519	AT	3	6	6845	6850	50 %	50 %	0 %	0 %	332798030
136	NC_015519	AGG	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798030
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